双向柱形图-BioLadder云平台 - 知乎
1.什么是双向柱形图?
双向柱状图(又名正负条形图),使用正向和反向的柱子显示类别之间的数值比较。其中分类轴表示需要对比的分类维度,连续轴代表相应的数值。其实就是由两个不同数据系列的柱形图组成的。
在组学数据分析中,双向柱形图可以很直观的看到,上下调蛋白,注释到该通路下的数量。
当然双向柱形图的作用不止如此,下面让我们一起来看看双向柱形图该怎么画吧。
2.绘图前的数据准备
demo数据可以在https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/model/ggplot2/DoublePositionBarPlot/demo.txt下载。
包含3列数据,第一列为每个柱子的名字,第二列为第一个方向上的数值,第三列为第二个方向上的数值。
3. BioLadder生信云平台在线绘制双向柱形图
不想写代码?可以用BioLadder生信云平台在线绘制双向柱形图。
网址:https://www.bioladder.cn/web/#/chart/70
3.1 上传文件
点击“选择”按钮上传自己的文件
备注:
点击查看按钮可以查看自己的上传的数据;
点击下载示例,可以下载demo数据;
支持txt,csv,xlsx,xls四种格式;
3.2 调整参数
3.2.1 双向柱形图特有参数
根据需求调整参数即可
柱子的宽度:调整图中柱子的宽度
请选择是否标注数字标签:可以自由决定是否加上数字标签,“更多”选项里可以调整标签的文字大小。
3.2.2 通用参数
坐标轴选项卡:可以调整坐标轴名字,刻度大小,方向等
颜色选项卡:可以调整图案颜色和透明度,以及可以选择画板背景主题。
3.3 提交查看
上传完数据,并调好参数后,点击右上方“提交”按钮,图像会出现在左侧。如果没有上传自己的数据,会使用默认的demo数据绘图。
3.4 下载
可以直接点击下载按钮,快捷下载当前所看到的图形。也可以点击更多选项,对图片的宽高,格式等做调整。
更多选项里,可以手动拖拽调整图片大小,也可以在下方的输入框内直接输入想要的大小,支持下载PNG,PDF,SVG,JPEG,BMP,EPS,TIFF等多种格式。
4.BioLadder生物信息在线分析可视化云平台
网址:https://www.bioladder.cn/
BioLadder目前上线了生物学分析最常用的50多个模块,主要包括以下四类:
数据可视化:箱线图,南丁格尔玫瑰图,韦恩图,UpSet图,饼图,词云图,小提琴图,双向柱形图,弦图,柱形图等
组学数据分析:序列的多重比对,表达数据的CV曲线图,双向柱形图,T-SNE,热图,相关性热图等,趋势分析的mFuzz,差异分析的火山图,富集分析的气泡图,修饰位点上下游模体分析的seqLogo,Motif热图等
功能分析:GO弦图,相互作用网络图,富集分析
数据预处理:归一化,补值,FDR校正,长宽表互换等
参考